Champ de tabac
European Sequencing of Tobacco
 
 
  

 
 

 
 
Nos objectifs

 

Le projet ESTobacco a vu le jour suite à l’appel à collaboration lancé lors de la table ronde « génomique » des 5èmes Journées Scientifiques du Tabac de Bergerac. Ce projet a pour but d’aboutir dans un premier temps au séquençage d'un large nombre de gènes du tabac (nicotiana tabacum).

Les travaux sur le génome du tabac devraient dans les années à venir permettre de mieux comprendre les interactions entre les gènes impliqués dans la formation des composés indésirables dans la fumée de cigarette. Un lien étroit existe en effet entre l’expression des gènes présents dans la plante de tabac, la composition chimique du tabac brut, et la formation de composés supposés être toxiques dans la fumée de cigarette.

Ce projet a pour ambition d’être complémentaire d’autres projets actuellement en cours concernant le séquençage du génome du tabac. La stratégie de séquençage retenue consiste à séquencer seulement les gènes exprimés chez le tabac et non l’ensemble du génome (95% de l’ADN du génome n’étant pas exprimé). La taille du génome du tabac est en effet trop importante pour être séquencé dans son intégralité (29 fois plus importante que celle d’A. thaliana).

Grâce à l’obtention de ces séquences, le développement d’une puce à ADN pourrait permettre l’étude à grande échelle de l’expression des principaux gènes du tabac. Ce nouvel outil devrait se concrétiser par l’accélération des travaux déjà en cours concernant la compréhension de l'origine des risques associés à l'usage du tabac et offrir à plus long terme l’opportunité de les réduire.

Afin d’encourager les initiatives de recherche de tous ordres concernant la génétique du tabac, ainsi que sur d’autre plantes, l’ensemble des séquences issues de ce projet sont librement accessibles à l’ensemble de la communauté scientifique sur les bases de données publiques.

 

 

 

 

 

 
 

 

Nouveau

20/11/06: les clones bactériens sont accessibles au CNRGV de Toulouse


12/07/06: un jeu d'unigènes de Nicotiana tabacum et des annotations sont disponibles sur notre site.


27/04/06: le séquençage de 56000 clones est achevé. 46546 séquences d'ESTs sont librement accessibles au public dans les bases de données EMBL et Genbank.


09/12/05: 6515 séquences d'ESTs supplémentaires portent le total de séquences disponibles à 11776.


03/10/05: 5261 nouvelles séquences d'ESTs disponibles dans les bases de données EMBL et Genbank.